半胱胺酸蛋白酶蛋白-3（抗原）樣本的物種 應選擇物種相同或有交叉反應的抗體，抗體可能與不同物種的同種靶蛋白有交叉反應，因其氨基酸序列同源性較高，如果樣本的種類未列入抗體說明書上的交叉反應種屬表中，并不意味著該抗體不適用于檢測該物種的蛋白，而只是表示該物種尚未用此抗體檢測驗證過，應通過序列比對的方法來預測交叉反應，可應用Expasy 和 NCBI BLAST 來進行不同物種蛋白同源性比對。
半胱胺酸蛋白酶蛋白-3（抗原）一抗宿主物種的選擇一般說來，在使用偶聯二抗結合無偶聯物的一抗時，一抗宿主動物的物種選擇較為重要，對于免疫組化而言，盡可能選擇與樣本不同種系物種的一抗，從而避免二抗與樣本內源性免疫球蛋白產生交叉反應，例如：檢測小鼠樣本蛋白，則不應選擇小鼠或大鼠源的一抗，選兔源的一抗，則二抗則可選擇偶聯了檢測分子（酶、熒光素、等）的抗兔IgG。
如果選擇有偶聯物的一抗則不適用上述情況，除免疫組化外的其它對不含內源性免疫球蛋白樣本的檢測方法，則抗體宿主物種的影響不大，如對不含IgG 的細胞裂解物樣本的western blotting檢測，盡管如此，含有血清的組織裂解物和組織培養上清中含有免疫球蛋白，還原變性樣本中含IgG，在western blot 檢測中則結合出現IgG 分子50 and 25 kDa 的重鏈和輕鏈條帶。
二抗的選擇 二抗應選用與使用的一抗相同的物種來源，例如：如果你的一抗是小鼠的單克隆抗體，二抗則選抗小鼠的二抗anti-mouse secondary。建議檢查二抗說明書確保該抗體適用于你的檢測應用， 二抗一般連接熒光素FITC 或發光團。
上海谷研生物科技有限公司特殊抗體的保存條件：
. 酶聯抗體：永遠保存在4 度，避免凍起來。否則會導致酶活性的下降或者喪失
2. 偶聯抗體：所有偶聯抗體都是在棕色管中或使用錫箔紙避光保存。尤其是熒光抗體，對
光極為敏感，因此在所有的實驗階段也是要避光操作的！
3. IgG3 的同型對照：永遠保存在4 度，避免凍起來。因為如果出現凍融過程，該抗體非常
容易形成多聚體無論是保存還是運輸，避免反復凍融！
反復凍融會導致抗體變性，導致多聚體形成，從而降低抗體的結合能力！
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     關于加入甘油保存：有些人會加50%的甘油到抗體中來避免反復凍融，甘油在-20 度 會降低冰點。這對很多抗體可能是可行的。但是abcam 僅對非常小的一部分抗體檢測過其在這種條件下的穩定性；而abcam 只對按照條件保存的抗體提供質量保證！加入甘油的溶液不建議在-80 度保存，因為這已經超過了甘油的冰點。如果您要加入甘油來保存抗體的話，請謹慎注意無菌操作，避免污染！
關于蛋白保護劑：
蛋白在高濃度時更不容易降解（ mg/ml 或者更高），這就是為什么在抗體中加入BSA 之類作為穩定劑的原因了；另一方面，加入的蛋白也可以減少抗體由于管壁吸附所造成的損失。但是如果抗體要用來標記的話，則不能加入蛋白穩定劑，因為這些穩定劑會和抗體一起競爭結合標記物。